Bioprospection micro-organismes des milieux extrêmes

Bioprospection et biodiversité des micro-organismes des milieux extrêmes des lagons de la Nouvelle-Calédonie

Responsable du projet : Jean GUEZENNEC, Ifremer/Brest (jguezenn@ifremer.fr)

Cette opération, qui implique la Délégation de l’Ifremer/Nouvelle-Calédonie, le Département Biotechnologies Marines de l’Ifremer/Brest, et l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie, est financée par le Secrétariat d’Etat à l’Outre-Mer à hauteur de 36 000 Euros.
L’objectif de ce projet de recherche est l’étude de la biodiversité microbienne des zones maritimes intertidales (tannes, mangroves, platiers).
La première étape de cette étude s’est déroulée du 8 au 20 avril 2010. La campagne de prélèvements et d’analyses bactériologiques a commencé par la collecte des micro-organismes présents dans les biotopes concernés, et la constitution d’une collection de souches (« souchothèque ») disponible pour des études ultérieures.
Dans une seconde étape, cette collection pourra servir de base à un projet de recherche et développement, dont l’objectif serait l’étude et la valorisation éventuelle de ces micro-organismes grâce à des applications dans les mondes médical et industriel :

  • constituants cellulaires ;
  • biosynthèse de métabolites primaires et secondaires ;
  • recherche d’enzymes endo- et/ou exo-cellulaires.

Quatre sites de prélèvement ont été prospectés :

  • en Province Nord, côte Ouest, la région de Koné (presqu’île de Foué), et la région de Temala (Canecout) : zones de tannes et de mangroves, et platier rocheux de Foué ;
  • en Province Nord, côte Est, la région de Poindimié (Tieti) ;
  • en Province Sud, la région de Tontouta (Nord estuaire) et la région de Boulouparis (presqu’île de Beaupré) : zones de tannes, arroyos et platier rocheux de Beaupré ;

 

  • dans le lagon Sud, platier corallien de l’îlot Amédée.

Deux méthodes de collecte ont été utilisées :

  • prélèvements directs au moyen d’écouvillons ;
  • prélèvements au moyen de capteurs statiques de type "pagode" positionnés sur site pendant 2 à 4 jours.

 

 

 

Après mise en culture sur des milieux spécifiques ou non spécifiques, puis isolement, ces collections de bactéries sont conservées dans une souchothèque calédonienne (en congélation à -80°C, et/ou lyophilisation, et/ou azote liquide) à l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie et/ou à l’Ifremer/Nouvelle-Calédonie.

 

 

Contacts en Nouvelle-Calédonie :
Yannick Labreuche : ylabreuc@ifremer.fr
Denis Coatanéa : dcoatane@ifremer.fr